戴爾EMC為Garvan醫(yī)學(xué)研究所提供了一個(gè)新的HPC系統(tǒng)，以支持基因組研究和分析。Garvan醫(yī)學(xué)研究所宣布將接收一種新的高性能計(jì)算(HPC)系統(tǒng)，以支持基因組研究和分析?；蚪M學(xué)是研究個(gè)體DNA中編碼的信息，允許研究人員研究基因如何影響健康和疾病，研究所的使命是為醫(yī)學(xué)研究做出重大貢獻(xiàn)，這將改變科學(xué)和醫(yī)學(xué)的方向并對其產(chǎn)生重大影響。人類健康。新的超級(jí)計(jì)算系統(tǒng)由戴爾EMC提供，將由Garvan的數(shù)據(jù)密集型計(jì)算機(jī)工程(DICE)小組使用。

Garvan研究所是澳大利亞最大的醫(yī)學(xué)研究機(jī)構(gòu)之一，專注于癌癥，糖尿病和新陳代謝，基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)，免疫學(xué)和炎癥，骨質(zhì)疏松癥和骨骼生物學(xué)以及神經(jīng)科學(xué)的研究。

根據(jù)Garvan的Kinghorn臨床基因組學(xué)中心的信息學(xué)主任Warren Kaplan博士的說法，基因組學(xué)需要大量的計(jì)算能力來分析數(shù)據(jù)。

“我們希望改變醫(yī)學(xué)的方向，并對人們的健康產(chǎn)生改變生活的影響。我們認(rèn)為基因組學(xué)是推動(dòng)這種變革的關(guān)鍵，如果沒有計(jì)算基礎(chǔ)設(shè)施，我們就無法實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)，”卡普蘭說過。

另見：圖片：世界上最快的25臺(tái)超級(jí)計(jì)算機(jī)

(TechRepublic)

根據(jù)國家人類基因組研究所的數(shù)據(jù)，當(dāng)?shù)谝粋€(gè)人類基因組測序時(shí)，1990年開始的項(xiàng)目耗時(shí)超過10年，耗資約27億美元。

現(xiàn)在，Garvan每天可以以大約1,000美元的基本價(jià)格排序多達(dá)50個(gè)基因組。

為了有效地存儲(chǔ)，分析和使用這種基因組信息，Garvan需要大量的計(jì)算資源和數(shù)據(jù)存儲(chǔ) - 每個(gè)人的基因組數(shù)據(jù)包含超過60億個(gè)堿基和大約500萬個(gè)遺傳變體，需要700個(gè)小時(shí)才能處理。

“這項(xiàng)技術(shù)改變了我們科學(xué)的方式，”卡普蘭繼續(xù)說道。“這使我們能夠?qū)arvan轉(zhuǎn)變?yōu)閿?shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的醫(yī)學(xué)研究機(jī)構(gòu)，我們排序的基因組越多，我們就能越多地利用這些信息為未來的研究提供信息。”

該研究所表示，新系統(tǒng)預(yù)計(jì)將支持幾個(gè)基因組數(shù)據(jù)集，包括悉尼基因組學(xué)協(xié)作和醫(yī)學(xué)基因組參考庫，并將有助于推動(dòng)澳大利亞基因組癌癥醫(yī)學(xué)計(jì)劃和其他計(jì)劃。

DICE HPC系統(tǒng)基于戴爾EMC的第14代PowerEdge高性能計(jì)算技術(shù)構(gòu)建。

該解決方案將在47臺(tái)戴爾EMC PowerEdge服務(wù)器上為臨床研究人員提供1,632個(gè)英特爾至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器內(nèi)核的基因組處理能力。10個(gè)英特爾Arria 10 GX FPGA;122,880 Nvidia Tesla V100 CUDA核心;15,360個(gè)Nvidia Tensor核心，有望加速HPC和AI技術(shù);744TB的NVMe加速基因組數(shù)據(jù)集的內(nèi)存處理;41TB DDR4 RAM內(nèi)存;和530TB可用容量CephFS存儲(chǔ)