導(dǎo)讀：EB病毒(EBV)相關(guān)胃癌(GC)表現(xiàn)出有趣的免疫治療反應(yīng)。然而，EBV壓印腫瘤免疫和治療反應(yīng)的細(xì)胞基礎(chǔ)仍不明確。

近日，中山大學(xué)徐瑞華及澳門(mén)大學(xué)張海燕共同通訊在《Signal Transduction and Targeted Therapy》（IF=39）在線發(fā)表題為“Dynamic single-cell mapping unveils Epstein-Barr virus-imprinted T-cell exhaustion and on-treatment response”的研究論文，該研究通過(guò)縱向scRNA-seq和配對(duì)scTCR/BCR-seq精細(xì)表征了免疫化療治療人EBV (+) GC的動(dòng)態(tài)腫瘤免疫環(huán)境。

研究背景

01

胃癌（GC）仍然是癌癥相關(guān)死亡的主要原因，在全球范圍內(nèi)，特別是在東亞，胃癌患病率很高。在過(guò)去十年中，免疫檢查點(diǎn)抑制劑（ICIs）的引入為各種類(lèi)型的癌癥的治療方法帶來(lái)了重大轉(zhuǎn)變。然而，PD-1/PD-L1通路阻斷作為單一療法的臨床有效性僅在約10%的胃癌（GC）患者中觀察到，在化療中添加抗PD-1 / PD-L1抗體在先前未經(jīng)治療的晚期胃癌（GC）患者中顯示出與單獨(dú)化療相比的更好療效。因此，這種組合被提議作為GC患者的新標(biāo)準(zhǔn)一線治療。盡管有這種有希望的臨床進(jìn)展，但只有一小部分GC患者可能從免疫化療中獲得持久的益處。因此，仍然迫切需要確定預(yù)測(cè)臨床反應(yīng)的生物標(biāo)志物。在這方面，目前正在評(píng)估愛(ài)潑斯坦巴爾病毒（EBV）陽(yáng)性，似乎很有希望。

EBV（+）GC是由癌癥基因組圖譜（TCGA）研究網(wǎng)絡(luò)確定的一個(gè)不同子集。越來(lái)越多的數(shù)據(jù)，包括我們團(tuán)隊(duì)的前瞻性臨床試驗(yàn)，表明EBV（+）GC中的ORR至PD-1抑制劑比EBV （?） GC高~25%。盡管在理解EBV（+）GC的臨床特征方面取得了重大進(jìn)展，但有關(guān)病毒-宿主免疫相互作用及其獨(dú)特特征的重要問(wèn)題仍然存在。理解EBV（+）GC中對(duì)免疫治療的超敏反應(yīng)，對(duì)理解所涉及的特定免疫反應(yīng)至關(guān)重要。

晚期EBV（+）GC和EBV（?）GC的獨(dú)特單細(xì)胞免疫景觀

02

在執(zhí)行主成分分析（PCA）或使用均勻流形近似和投影（UMAP）可視化數(shù)據(jù)之前，我們首先合并并歸一化了所有樣品，以構(gòu)建患者之間的參考細(xì)胞圖譜。這樣做是為了考慮轉(zhuǎn)錄譜中的任何批次效應(yīng)。經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)預(yù)處理和質(zhì)量控制，我們將免疫細(xì)胞分為六個(gè)主要簇：T細(xì)胞，NK細(xì)胞，B細(xì)胞，漿細(xì)胞，骨髓細(xì)胞和肥大細(xì)胞（圖1d）。細(xì)胞的聚類(lèi)由已建立的標(biāo)記基因的共同表達(dá)特征決定（圖1e）。每個(gè)單獨(dú)的樣本為所有細(xì)胞亞群貢獻(xiàn)了代表性細(xì)胞。批量效應(yīng)的影響很小。

EBV（+）GC和EBV（?）GC 之間的直接比較顯示，前者具有更發(fā)炎的免疫表型，其中 T 細(xì)胞和 B 細(xì)胞浸潤(rùn)更多。EBV（?）GC顯示免疫抑制腫瘤微環(huán)境（TME），漿細(xì)胞，骨髓細(xì)胞和肥大細(xì)胞富集（圖1f）。兩組B細(xì)胞和漿細(xì)胞均顯著增加，而髓系細(xì)胞在聯(lián)合治療后均呈下降趨勢(shì)，表明主要免疫細(xì)胞類(lèi)型發(fā)生動(dòng)態(tài)變化。T細(xì)胞是與治療反應(yīng)相關(guān)的主要免疫細(xì)胞簇。通過(guò)檢查所有T細(xì)胞（n = 48,070）中配對(duì)的TCRα和TCRβ庫(kù)，我們發(fā)現(xiàn)EBV（+）GC中61.48-73.12%的T細(xì)胞含有至少一個(gè)生產(chǎn)性TCRα或β鏈;EBV（?）GC中35.30–70.43%的T細(xì)胞具有多個(gè)克隆型。此外，EBV（+）GC中13.50-33.41%的T細(xì)胞過(guò)度擴(kuò)增（100

研究結(jié)果

03

最近單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNAseq)在腫瘤微環(huán)境研究中的應(yīng)用為浸潤(rùn)腫瘤的免疫細(xì)胞的生物學(xué)提供了有價(jià)值的見(jiàn)解此外，破譯浸潤(rùn)T/B細(xì)胞的精確TCR/BCR克隆型增強(qiáng)了人們對(duì)適應(yīng)性免疫反應(yīng)的理解，并為確定潛在的治療靶點(diǎn)提供了有價(jià)值的見(jiàn)解。在這項(xiàng)研究中，作者使用scRNA-seq和單細(xì)胞TCR/BCR測(cè)序技術(shù)，表征了EBV(+)和EBV (-) GC患者在免疫化療前后的動(dòng)態(tài)腫瘤免疫環(huán)境。通過(guò)研究免疫化療耐藥和敏感性的潛在機(jī)制，可以發(fā)現(xiàn)對(duì)治療有反應(yīng)的特定免疫細(xì)胞亞型。該研究描述了EBV壓印治療T細(xì)胞免疫在GC中的獨(dú)特含義，這可以用于優(yōu)化精確免疫治療的合理設(shè)計(jì)。