BioEdit軟件是一款為分子生物學(xué)科研人員提供的序列對(duì)比工具，這款軟件可以讓你在電腦上通過簡(jiǎn)單的點(diǎn)擊操作查看和操作序列。這款軟件和同類工具DNAMAN 相比，其分析內(nèi)容相對(duì)更豐富一些，并且提供了很多網(wǎng)絡(luò)程序的分析界面和接口。

首先要把所有的序列到windows自帶的記事本中，全部以fasta格式存到同一個(gè)文件中，保存成*.txt，序列內(nèi)部最好不要有空格或者換行。序列格式舉例如下：“>序列1ATCG..........ATCG>序列2ATCG..........ATCG>序列3ATCG..........ATCG>序列4ATCG..........ATCG”

然后用Bioedit打開剛才保存的文件*.txt，點(diǎn)擊窗口上方的Accessory application菜單，再點(diǎn)擊clustelW multiple alignment，這時(shí)候會(huì)彈出一個(gè)窗口，直接選擇Run clustalW，又彈出一個(gè)窗口，選擇ok，等待結(jié)果就行了。最后的比對(duì)結(jié)果可以保存成*.fas格式，適用于各種分析。

手對(duì)齊的幾種模式

自動(dòng)化ClustalW對(duì)齊

自動(dòng)爆炸搜索（本地和WWW）

質(zhì)粒繪圖和注釋

附件應(yīng)用程序配置

限制映射