體育在線官方 是一款專業(yè)的生物新信息軟件，DNAMAN可以用于多序列比對(duì)、PCR 引物設(shè)計(jì)、限制性酶切分析、質(zhì)粒繪圖、蛋白質(zhì)分析等，幾乎囊括了所有日常核酸、蛋白質(zhì)序列的分析工作。DNAMAN內(nèi)置圖形分析，您可以將自己的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)發(fā)布到軟件上，利用自動(dòng)統(tǒng)計(jì)以及圖表功能獲得詳細(xì)的數(shù)據(jù)走勢(shì)分析，為后期的模擬實(shí)驗(yàn)提供重要的參考數(shù)據(jù)。

兩個(gè)引物互補(bǔ)

您可以使用DNAMAN檢查兩個(gè)寡核苷酸序列的互補(bǔ)性。 要執(zhí)行此功能，第二個(gè)引物應(yīng)通過選擇引物|載入DNAMAN存儲(chǔ)器 兩個(gè)Primer互補(bǔ)命令。

DNAMAN搜索兩個(gè)引物之間的互補(bǔ)序列。 結(jié)果表明兩個(gè)引物之間的連續(xù)和不連續(xù)的互補(bǔ)序列。

PCR引物設(shè)計(jì)

您可以使用DNAMAN選擇滿足您擴(kuò)增模板DNA要求的PCR引物。 設(shè)計(jì)了許多參數(shù)來篩選PCR引物，例如PCR產(chǎn)物大小，引物長(zhǎng)度，Tm，GC組成和鹽濃度的范圍。 其他參數(shù)用于排除“低質(zhì)量”引物。

導(dǎo)入和導(dǎo)出記錄

從文本文件導(dǎo)入記錄

從文本文件導(dǎo)入寡核苷酸序列是將大量oligo記錄添加到數(shù)據(jù)庫(kù)的便捷工具。

DNAMAN將記錄的信息列入七個(gè)字段：名稱，來源，備注，長(zhǎng)度，GC含量，熔解溫度和序列。如果數(shù)據(jù)庫(kù)中有大量記錄，則可以使用前四個(gè)字段作為排序鍵，以便在“記錄列表”框中選擇性地顯示記錄。

導(dǎo)向不匹配

定向錯(cuò)配可以通過在突變附近的位點(diǎn)引入單次或雙重錯(cuò)配來創(chuàng)建或去除當(dāng)前DNA序列或其變體上的限制性位點(diǎn)。 使用此功能，您可以創(chuàng)建或破壞限制性位點(diǎn)，以區(qū)分野生型等位基因與常見突變體等位基因。

將待分析的序列裝入Channel,點(diǎn)擊要分析的Channel,然后通過Restriction/Analysis 命令打開對(duì)話框.參數(shù)說明如下：Results 分析結(jié)果顯示其中包括：Show summary（顯示概要） Show sites on sequence（在結(jié)果中顯示酶切位點(diǎn)）?Draw restriction map（顯示限制性酶切圖）Draw restriction pattern（顯示限制性酶切模式圖）?Ignore enzymes with more than（忽略大于某設(shè)定值的酶切位點(diǎn)）?Ignore enzymes with less than（忽略小于某設(shè)定值的酶切位點(diǎn)）?Target DNA （目標(biāo)DNA 特性）?circular（環(huán)型DNA）,dam/dcm methylation（dam/dcm 甲基化）參數(shù)說明如下：Enzyme?代表（enzyme data file）,點(diǎn)擊旁邊的下拉按鈕,出現(xiàn)兩個(gè)默認(rèn)選項(xiàng),restrict.enz 和dnamane.enz,如果添加過自制的酶列表,則附加顯示自制酶列表文件名.其中restrict.enz 數(shù)據(jù)文件包含180 種?限制酶,dnamane.enz 數(shù)據(jù)文件包含2524 種限制酶.選擇其中一個(gè)數(shù)據(jù)文件,相應(yīng)的酶在左邊的 顯示框中列出（按酶名稱字母表順序）,鼠標(biāo)雙擊酶名稱,則對(duì)應(yīng)的酶被選中,在右邊空白框中列 出.要自制酶切列表,可以從左邊酶列表中雙擊鼠標(biāo)選擇多種酶（例如puc18 multiple cloning sites）,然后點(diǎn)擊按鈕出現(xiàn)下列對(duì)話框：輸入要保存酶列表的文件名,點(diǎn)擊按鈕即可保存.自制酶列表可以方便分析特定的酶切位點(diǎn).Cutter 酶切識(shí)別序列長(zhǎng)度；End 酶切產(chǎn)生的末端,其中包括,Blunt（平頭末端）,5’Overhang?（5’突出粘性末端）,3’Overhang(3’突出粘性末端),系統(tǒng)根據(jù)cutter 和end 的設(shè)定情況,在左邊酶列表 中顯示符合條件的酶.最后,點(diǎn)擊按鈕執(zhí)行操作.

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