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          先進(jìn)的計算機(jī)技術(shù)和軟件使物種識別互動

          2019-06-03 15:44:38來源:
          導(dǎo)讀代表一組成功的生物防治劑用于各種害蟲果蠅,寄生黃蜂屬仍然在很大程度上被忽視。雖然其最新識別密鑰可以追溯到1969年,但自那時以來已添加

          代表一組成功的生物防治劑用于各種害蟲果蠅,寄生黃蜂屬仍然在很大程度上被忽視。雖然其最新識別密鑰可以追溯到1969年,但自那時以來已添加了許多新物種。似乎更糟糕的是,這組視覺上相同的物種很可能包含許多尚未被描述為科學(xué)新物種的物種。

          瑞士伯爾尼自然歷史博物館的科學(xué)家Fabian Klimmek和Hannes Baur最近在中歐研究了這些黃蜂的物種群,不僅展示了知識更新的必要性,還展示了現(xiàn)代分類學(xué)軟件能夠分析的優(yōu)勢。大量的描述性和定量數(shù)據(jù)。

          在開放獲取的生物多樣性數(shù)據(jù)期刊上發(fā)表,該團(tuán)隊的分類學(xué)論文描述了一個新物種 - Pteromalus capito - 并討論了由Pierre-and-Marie的信息學(xué)和系統(tǒng)學(xué)實驗室開發(fā)的免費(fèi)使用的Xper3。 -Curie大學(xué)。該軟件用于為物種組Pteromalus albipennis創(chuàng)建一個公開可用的更新密鑰。

          充分說明的交互式數(shù)據(jù)庫涵蓋了該組中的27個物種和18個相關(guān)物種,除了完整的診斷,大量的身體測量和總共585個圖像,顯示了每個物種的大部分特征。

          “如今,先進(jìn)的計算機(jī)技術(shù),測量程序和設(shè)備允許更復(fù)雜的方法來包含數(shù)量特征,這極大地增強(qiáng)了隱秘物種的劃界,”科學(xué)家解釋說。

          “最近開發(fā)的用于創(chuàng)建Xper3,Lucid或Delta等生物識別鍵的軟件可能有可能取代傳統(tǒng)的紙質(zhì)鍵。”

          為了將該陳述置于上下文中,作者給出了一個研究的黃蜂種類的例子,如果使用先前可用的識別密鑰,其識別將需要16個步驟,而交互式替代方案僅需要6個步驟。

          像Xper3這樣的工具如此快速和有效的原因之一是,密鑰的作者可以按特定順序列出所有描述性字符,并在物種劃分中賦予它們不同的權(quán)重。因此,每當(dāng)昆蟲學(xué)家試圖識別黃蜂標(biāo)本時,軟件將首先對頂部的描述符進(jìn)行檢查,以便它可以排除不匹配的分類單并提供剩余名稱的列表。每當(dāng)剩下多個名字時,就會在列表的下方進(jìn)行檢查,直到剩下一個,這應(yīng)該是與樣本相對應(yīng)的一個。在任何時候,研究人員都可以訪問年表,以便在不中斷過程的情況下檢查是否存在任何可能的不匹配。

          作為數(shù)字可用軟件的產(chǎn)品,交互式識別密鑰不僅容易,快速且廉價地發(fā)布,而且它們也易于以協(xié)作方式編輯和構(gòu)建。只要作者授予他們特定的用戶權(quán)限,來自世界各地的專家就可以更新密鑰。但是,無論數(shù)據(jù)庫的更新次數(shù)如何,永久URL鏈接將始終提供對最新版本的訪問。

          為了證明其關(guān)鍵及其基礎(chǔ)數(shù)據(jù)的未來發(fā)展,科學(xué)家們將所有原始數(shù)據(jù)文件,R腳本,照片,文件列表和準(zhǔn)備好的樣本存放在由OpenAIRE和CERN創(chuàng)建的研究數(shù)據(jù)Zenodo中。

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